ศูนย์วิจัยญี่ปุ่นศึกษา ประจำกรุงปักกิ่ง (ชื่อย่อ ศูนย์วิจัยญี่ปุ่น) ก่อตั้งขึ้นในปี 1985 ภายใต้การสนับสนุนของกระทรวงศึกษาธิการและมูลนิธิแลกเปลี่ยนระหว่างประเทศของญี่ปุ่น ภายใต้การนำของมหาวิทยาลัยภาษาต่างประเทศปักกิ่ง สามสิบปีมีประวัติความเป็นมาที่รุ่งโรจน์และได้ผลิตบัณฑิตระดับปริญญาโทมากกว่า 1,000 คน ปริญญาเอกและอาจารย์รวมถึงบุคลากรสูง ผู้เชี่ยวชาญด้านการวิจัยญี่ปุ่นศึกษา

ศูนย์วิจัยญี่ปุ่นเป็นหน่วยงานของกระทรวงศึกษาธิการที่ให้ปริญญาบัตรในระดับปริญญาโทและเอก เป็นหน่วยงานที่กระทรวงศึกษาธิการและรัฐบาลปักกิ่งให้ความสำคัญ และยังเป็นศูนย์วิจัยรัฐศาสตร์และภูมิภาคศึกษา ศูนย์วิจัยญี่ปุ่นมีอาจารย์ทั้งหมด 26 ท่าน เป็นศาสตราจารย์ 9 ท่าน รองศาสตราจารย์ 3 ท่าน อาจารย์ผู้สอน 2 ท่าน มีทิศทางการวิจัย 6 แนวทาง ได้แก่ ภาษาญี่ปุ่น ญี่ปุ่นศึกษา วรรณกรรมญี่ปุ่น วัฒนธรรมญี่ปุ่น สังคมญี่ปุ่น เศรษฐกิจญี่ปุ่น ขณะนี้มีนักศึกษาปริญญาโท 109 คน หลักสูตรสองปริญญาเป็นนักศึกษาญี่ปุ่น 1คน นักศึกษาระดับปริญญาเอก 47 คน นักศึกษาหลังปริญญาเอก 1 คน, นักวิชาการระดับสูง 2 คน ฝึกอบรมครูผู้สอน 1 คน

ศูนย์วิจัยญี่ปุ่นเป็นความร่วมมือระหว่างจีนกับญี่ปุ่น  เป็นวิธีการร่วมมือการฝึกอบรม  มูลนิธิแลกเปลี่ยนระหว่างประเทศของญี่ปุ่นได้ส่งนักวิจัยและศาสตราจารย์มาบรรยายที่ศูนย์เป็นประจำทุกปี ที่ศูนย์มีระบบการจ้างและเชิญอาจารย์เข้ามาเป็นศาสตราาจารย์พิเศษ และจ้างนักวิชาการที่มีชื่อเข้ามาสอนในศูนย์ 

ศูนย์วิจัยยังร่วมมือกับมหาวิทยาลัยโกเบ , มหาวิทยาลัยโอกายาม่าลงนามในสัญญาการศึกษาระดับปริญญาโทและได้รับปริญญาบัตรจากสองสถาบัน ในขณะเดียวกันก็ลงนามข้อตกลงความร่วมมือกับมหาวิทยาลัยโตเกียว มหาวิทยาลัยโอซาโนมิซู มหาวิทยาลัยวาเซดะของญี่ปุ่น ศูนย์วิจัยวรรณกรรมแห่งชาติ มหาวิทยาลัยมิเอะและมหาวิทยาลัยนาโกย่า การศึกษาภาษาต่างประเทศมหาวิทยาลัยชินชูและมหาวิทยาลัย สถาบันอื่น ๆ รวม 23 แห่ง 

ในห้องสมุดกลางของศูนย์มีหนังสือภาษาญี่ปุ่นและภาษาจีนรวมประมาณ 170,000 เล่ม จำนวนหนังสือและคุณภาพอยู่ในระดับต้นของหอสมุดมหาวิทยาลัยทั่วประเทศ