২০০৯ সালে বিএফএসইউ’র কম্পিউটার বিজ্ঞান বিভাগ প্রতিষ্ঠার পূর্বে স্কুলটি ১৯৯০ সালে কম্পিউটার কেন্দ্র হিসেবে প্রতিষ্ঠিত হয়েছিল। এখানে কম্পিউটার বিজ্ঞান ও প্রযুক্তি ক্ষেত্রে পড়াশোনার জন্য ছাত্রছাত্রীদের ভর্তি করা হয় এবং আন্তর্জাতিক প্রেক্ষাপটে কম্পিউটার বিজ্ঞানের উন্নয়নে শিক্ষার্থীদের পেশাগতভাবে দক্ষ করে গড়ে তোলা হয়।
বর্তমানে কম্পিউটার বিজ্ঞান বিভাগে ১১ জন শিক্ষক আছেন, যাদের অধিকাংশই পিএইচ.ডি ডিগ্রি বা উর্ধ্বতন পেশাগত উপাধি লাভ করেছেন। বিগত ৫ বছরে কম্পিউটার বিজ্ঞান বিভাগ কয়েকটি বড় প্রকল্প সাফল্যের সঙ্গে সম্পূর্ণ করেছে, যেমন চীনের জাতীয় প্রাকৃতিক বিজ্ঞান তহবিলের(National Natural Science Foundation) আর্থিক সমর্থনে ২টি প্রকল্প, জাতীয় সামাজিক বিজ্ঞান তহবিলের(National Social Science Foundation) আর্থিক সমর্থনে ২টি প্রকল্প এবং প্রদেশিক ও মন্ত্রণালয় শ্রেণীর ৬টি প্রকল্প। এই স্কুলের শিক্ষক ও শিক্ষার্থীরা বিভিন্ন আন্তর্জাতিক সম্মেলনে অংশগ্রহণ করে থাকেন এবং এসসিআই, ইআই ও সিএসএসসিআইসহ দেশ-বিদেশের বিভিন্ন একাডেমিক জার্নালে গবেষণামূলক প্রবন্ধ লিখে থাকেন।
কম্পিউটার বিজ্ঞান বিভাগের লক্ষ্য হচ্ছে কম্পিউটার হার্ডওয়্যার ও সফটওয়্যার এবং এপ্লিকেশন সংক্রান্ত মৌলিক তত্ত্ব আয়ত্ত করা, বিদেশী ভাষার যোগ্যতা, বাণিজ্য সংক্রান্ত জ্ঞান এবং কম্পিউটারে পারদর্শিতার পাশাপাশি শিক্ষার্থীরা যেন বিভিন্ন ক্ষেত্রের দক্ষতা দিয়ে বর্তমান তথ্য প্রযুক্তির দ্রুত উন্নয়ন ও অর্থনৈতিক বিশ্বায়নে নিজের অবদান রাখতে পারে সেভাবে প্রশিক্ষণ দেওয়া।
বর্তমানে এ বিভাগে স্নাতক শ্রেণীতে ৯৩ জন শিক্ষার্থী আছে। তারা বিভিন্ন প্রতিযোগিতায় অত্যন্ত ভাল ফলাফল অর্জন করেছে। তারা চীনের ‘দেশব্যাপী স্নাতক শ্রেণীর পাঠ্যক্রমের বাইরে বৈজ্ঞানিক ওয়ার্ক প্রতিযোগিতা চ্যালেঞ্জ কাপে’ দ্বিতীয় পুরস্কার পেয়েছে এবং চীনের ‘কলেজ ছাত্রছাত্রীদের কম্পিউটার ডিজাইন প্রতিযোগিতায়’ প্রথম পুরস্কার পেয়েছে। তাছাড়া মডেলিং ম্যাথিম্যাটিকেল প্রতিযোগিতায়ও তারা খুব ভাল ফলাফল পেয়েছে। এখানকার শিক্ষার্থীদের ইংরেজি ভাষাও উচ্চ মানের, তাদের অধিকাংশইTEM-4 (Test for English Major-Band 4)পাস করেছে এবং অন্তত অর্ধেকTEM-8 (Test for English Major-Band 8)পাস করেছে। শিক্ষাপ্রাপ্ত হওয়ার পর সাধারণত ছাত্রছাত্রীদের তিন ভাগের এক ভাগই বিদেশি বিশ্ববিদ্যালয়ে অধ্যয়নের জন্য আবেদন করে, যেমন সাউদার্ন ক্যালিফোর্নিয়া বিশ্ববিদ্যালয়, নর্থ ক্যারোলিনা বিশ্ববিদ্যালয় এবং ক্যামব্রিজ বিশ্ববিদ্যালয়, বাকি তিন ভাগের এক ভাগ চীনের সুবিখ্যাত বিশ্ববিদ্যালয়ে অধ্যয়ন করতে আবেদন করে, যেমন ছিংহুয়া বিশ্ববিদ্যালয়, পেকিং বিশ্ববিদ্যালয় এবং পেইচিং ইনস্টিটিউট অব টেকনোলজি। বাকি ছাত্রছাত্রীরা বিভিন্ন ব্যাংক, সরকারি সংস্থা এবং আইটি কোম্পানিতে চাকরি নিয়ে থাকে।